Menjadi program studi yang unggul dan kompetitif dalam bidang pengelolaan sumber daya kelautan dan pemberdayaan masyarakat pesisir berdasarkan nilai-nilai keislaman
Program studi Ilmu Kelautan mengembangkan ilmu di bidang kelautan untuk memahami karakter fenomena dan proses-proses yang terjadi di laut, baik proses fisika, kimia, biologi, dan geologi laut dengan memanfaatkan pengindraan jauh dan akustik kelautan untuk mengeksplorasi sumber daya, lingkungan laut, serta mengidentifikasi pencemaran laut. Program studi ini juga menerapkan ilmu dan teknologi dalam melakukan kajian sifat-sifat dan proses fisika dan kimia laut dan interaksinya dengan organisme di laut, serta pemodelan untuk mensimulasi dinamika pergerakan air laut dan prediksi sebaran limbah maupun material lainnya.