Mata kuliah Penelitian Manuskrip dirancang untuk mengajarkan mahasiswa metode penelitian dan kajian kritis terhadap manuskrip Islam. Melalui mata kuliah ini, mahasiswa akan mempelajari cara membaca, mengidentifikasi, dan menganalisis manuskrip kuno dengan pendekatan ilmiah. Materi mencakup studi paleografi, kodikologi, filologi, dan teknik digitalisasi manuskrip untuk pelestarian serta penyebarluasan pengetahuan. Dengan bimbingan teori dan praktik, mahasiswa diharapkan mampu menyelami sejarah, makna, dan konteks sosial-budaya dari teks manuskrip serta menyajikan hasil penelitian mereka dalam bentuk karya ilmiah.